ロサンゼルス空港で、フィンランドからの旅行者が入国審査で引っかかった。男は、世界一のハッカーと言われた男だった。男は黙秘をつづけていたが、サイバー犯罪取締官のロバーツ（ドン・チードル）の尋問にようやく口を開いた。

「"あの男"がどんなにおそろしいかわかってない。彼は空想を現実に変える男。でもすべては見せかけ。感情のカケラもない冷徹マシン。欲しいものを手に入れ、姿を消す…」などと、雇い主のことを語り出した。数分後、男は何者かに射殺された。

同時間帯、テキサス州ミッドランド。スタンリー（ヒュー・ジャックマン）はトレーラーでその日暮らしのような生活をしていた。数年前までは世界一のハッカーと言われ、国家安全保障局がもっとも恐れた男だった。

彼は、メール監視システムで盗聴を続けるFBIに抗議し、そのシステムに侵入・破壊してしまったのだ。しかしロバーツに逮捕され、それがもとでパソコンに近付くことを禁止され、妻とは離婚。愛するひとり娘のホリーの親権を奪われ、接近禁止命令を受けていた。

そんなスタンリーにジンジャー（ハル・ベリー）と名乗る美女が「話を聞くだけで10万ドル。娘に会えるようになる」という話を持ってきた。

ジンジャーが合わせたのは、ガブリエル・シアー（ジョン・トラボルタ）だった。彼は、元モサドのエリート・スパイで天才的犯罪者である。

ガブリエルは、80年代初めに麻薬取締局(DEA)が実行した麻薬資金の流れをつかむという極秘の作戦“ソードフィッシュ”実行中に生み出された、政府の不正な闇資金をコンピュータ回線で奪うつもりだ、スタンリーの力を貸して欲しい、と申し出る。

ガブリエルは、「私は国家のために闘っている。アメリカからテロを撲滅させるために、戦争を行っている。だが、それには資金が要る。だから、この作戦を遂行する必要があるんだ」と語る。

報酬は1000万ドル。当時4億ドルだったその資産は、利子とともに15年間眠り続け今では95億ドルもの巨額となっていた。ガブリエルは、「最高のハッカーは60分で破るが、おれは60秒で破る男を探してる」といきなりスタンリーに銃を突きつけた。スタンリーは引き受けるしかなかった。

ガブリエル同様、ジンジャーの正体も不明だったが、実はDEAの捜査官でガブリエルの資金の流れと黒幕を調査するため潜入しているとスタンリーに告白する。

生物教師のジェシカ(キム・ベイシンガー)は突然、自宅に押し入り、家政婦を殺害した男たちに誘拐される。犯人のリーダー格のイーサン(ジェイソン・ステイサム)はジェシカをある家の屋根裏部屋に監禁。さらにその部屋にあった電話を破壊し出て行く。

ジェシカは粉々になった電話を何とか使えるまでに修復し外部に助けを求める。そこで繋がったのは見ず知らずの青年ライアン(クリス・エヴァンス)の携帯電話だった。

最初は疑いながらも、その鬼気迫る様子に、ライアンはジェシカのことを信じる。切れそうになる電波を持たせながらジェシカ救出のために奔走する。まずは警察署に行き、そこで対応してくれたボブ巡査部長(ウィリアム・H・メイシー)に携帯を渡す。ジェシカは名前と住所を伝え、家政婦が殺害され、そこで押し入ってきた男たちに連れ去られた、と伝えた。

ボブ巡査部長は、半信半疑だったが、待合室で起こったケンカに対応を追われ、ライアンに4階にある刑事課に行くように伝える。だが、階段で電波が切れそうになり、ライアンは諦める。また、子供が学校から連れ去られてしまう可能性があるため、ライアンに「小学校に行って、子供を救って欲しい」、と伝える。

だが、犯人グループの方が早く、子供・リッキーは連れ去られてしまう。それを追うライアンだったが、途中で見失う。その途中で、電話の電池がなくなってしまいそうになったため、半ば強引に携帯ショップで充電器で購入し、乗っていた車が壊れてしまったため、車を奪った。

一方、ボブ巡査部長はジェシカの家を訪れる。だが、その家にはジェシカと名乗る女性がいた。誘拐などされていないのだ、と思ったボブ巡査部長だったが、その女は犯人グループの一味だった。

子供を連れ去り、さらに犯人グループは、目的であるジェシカの夫クレイグ（リチャード・バージ）の居場所をジェシカから聞きだそうとした。

「"レフト"とはどこだ？」。イーサンがジェシカを問いつめる。彼女の自宅の留守電に、そこで落ち合うようクレイグから電話があったのだ。目の前でリッキーを殺すと脅されたジェシカは、それがロサンゼルス空港のバーだと明かす。

家に帰ったボブ巡査部長だったが、そこでライアンの起こした事件(携帯ショップで発砲、車を奪った)がニュースになっていた。防犯カメラで、警察署に来ていた青年だ、と思ったボブ巡査部長は、ジェシカの家に電話をかける。留守番電話のメッセージが流れたが、それは対応した女性とまるっきり違う声だった。